Das Gebiet des Allgäu ist im Süden geografisch deutlich alpin ausgestattet. Die Allgäuer Alpen als Gebirgsgruppe befinden sich mit ihrem überwiegenden Anteil auf dem Territorium des Allgäu, ebenso ein kleiner Bereich des Ammergebirges und des Bregenzerwaldes. Die höchsten Erhebungen des Allgäus befinden sich im Zentrum des Hauptkammes der Allgäuer Alpen. In der Hornbachkette jedoch, einem Seitenkamm, der in das Gebiet Tirols hinein verläuft, befindet sich mit dem Großen Krottenkopf die höchste Erhebung. Er wurde mit einer aktuellen Höhe von genau 2657 m über N.N. vermessen. Der Hauptkamm bildet mit seinen Bergen direkt einen Teil der österreichisch-deutschen Grenze. Einige besonders markante Berggipfel sind der Hochvogel, die Mädelegabel, die Tettachspitze und der Widderstein. Zu Ihnen zählen ebenso der Schneck und die Höfats. Der Sattel zwischen diesen beiden Bergen zeichnet sich durch bemerkenswerte geologische Besonderheiten aus und ist bekannt durch seine große Artenvielfalt an Gebirgsblumen.
Zu den bekanntesten Bergen des Allgäu zählt das Nebelhorn, das mit der Seilbahn sehr gut zu erreichen ist. Besonders für Bergtouren ist das Nebelhorn ein besonders gut geeigneter Ausgangspunkt. Das nahe des Biberkopfes gelegene Haldenwanger Eck ist der südlichste Punkt Deutschlands. Die beiden Naturschutzgebiete Hoher Ifen und Allgäuer Hochalpen beanspruchen einen großen Bereich in den Allgäuer Alpen.
Die Allgäuer Voralpen mit ihren Bergen sind besonders bei Wanderern überaus beliebt, da Ihre Steilheit moderat ist und diesen kein alpinistisches Können abverlangen. Die Nagelflukette im Westen und das Wertacher Hörnle sowie der Grünter im Osten zählen zu diesen Bergen. Im Alpenvorland finden sich viele Berge mittelgebirgsartiger Ausprägung, sowohl als Ausläufer der Hochgebirgsketten als auch als Moränenhügel. Viele Seen bilden die Kulisse für einen einzigartigen Blick in Richtung Süden, der die Ketten der Allgäuer Alpen über den Wasserspiegeln des Großen Alpsees, des Hopfensees, des aufgestauten Forggensees, des Rottachsees oder des Grüntensees besonders malerisch und imposant erscheinen lassen.